CT-skanning (computer tomografi) er diagnostisk bedre end røntgenundersøgelse til påvisning af tidlige strukturelle ledskader i form af ledfladeerosioner, ledspalteændring samt øget knogletæthed (sklerose), men metoden kan ikke vise helt tidlig aktiv reumatisk inflammation i knoglemarv og ledspalte med mindre der anvendes moderne Dual-energy CT-teknik. CT kan dog være til hjælp ved diagnosticering af mindre erosive sacroiliacaleds-forandringer, som kan være vanskelige at se ved MR-skanning, samt til diagnosticering af anatomiske sacroiliacaleds variationer, såsom ekstra små led. I senere stadier af sygdommen kan CT være brugbar til påvisning af rygforandringer og er ofte værdifuld til påvisning og vurdering af brud i rygsøjlen.

CT er endvidere anvendelig til planlægning af kirurgisk behandling, billedvejledt blokadebehandling mm.

En CT-skanning er hurtig at udføre med moderne relativt kompliceret teknik, men giver desværre ofte en relativ stor stråledosis og skal derfor kun anvendes hvis nødvendigt med mindre der anvendes en teknik med lav stråledosis, som desværre også betyder at billedkvaliteten reduceres.